プルダウン/チェックボックス/ラジオボタンをフォームに設置する場合の「選択肢」において、 フォームに設置した選択肢のうちkintoneアプリ側に該当する選択肢がない場合は、 kintoneアプリの対象フィールドの選択肢は洗い替えされ自動生成されます（一度すべて削除されてから生成）

そのため、フォーム側の選択肢の追加（値の変更）をする場合で、kintone側の項目を削除されないようにしたい場合は、kintoneアプリ側で対象フィールドの選択肢を更新してからフォーム側も変更し「保存する」を押下することをお勧めいたします。